MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Natrinema pellirubrum DSM 15624

Total Repeats: 99972

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019962	GTCG	2	8	1	8	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019962	GT	3	6	163	168	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019962	TAG	2	6	195	200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019962	CGGAG	2	10	206	215	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_019962	C	6	6	216	221	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6	NC_019962	CGA	2	6	245	250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019962	GA	3	6	266	271	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019962	GCC	2	6	309	314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_019962	GA	3	6	345	350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019962	TAG	2	6	410	415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019962	TGT	2	6	452	457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019962	TA	3	6	488	493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019962	CCT	2	6	505	510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_019962	C	6	6	524	529	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_019962	G	6	6	570	575	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019962	CA	3	6	603	608	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_019962	TCG	2	6	694	699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019962	CGTC	2	8	737	744	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_019962	AGCC	2	8	757	764	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_019962	CGG	2	6	842	847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019962	AGC	2	6	872	877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019962	CGG	2	6	905	910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019962	ATCG	2	8	944	951	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019962	TTA	2	6	989	994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019962	GAAG	2	8	1064	1071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019962	GAC	2	6	1149	1154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
27	NC_019962	CGAGGT	2	12	1178	1189	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	433589360
28	NC_019962	CGA	2	6	1238	1243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
29	NC_019962	GAT	2	6	1266	1271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433589360
30	NC_019962	GCG	2	6	1279	1284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589360
31	NC_019962	AGG	2	6	1303	1308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433589360
32	NC_019962	GATCA	2	10	1353	1362	40 %	20 %	20 %	20 %	433589360
33	NC_019962	CGA	2	6	1372	1377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
34	NC_019962	CGC	2	6	1385	1390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589360
35	NC_019962	CGA	2	6	1610	1615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
36	NC_019962	CGA	2	6	1622	1627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
37	NC_019962	CTG	2	6	1638	1643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589360
38	NC_019962	CGA	2	6	1691	1696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
39	NC_019962	G	6	6	1821	1826	0 %	0 %	100 %	0 %	433589360
40	NC_019962	CGG	2	6	1864	1869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589360
41	NC_019962	GCC	2	6	1914	1919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589360
42	NC_019962	CGA	2	6	1958	1963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
43	NC_019962	CGAGA	2	10	1965	1974	40 %	0 %	40 %	20 %	433589360
44	NC_019962	GAC	2	6	2001	2006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
45	NC_019962	CCGA	2	8	2043	2050	25 %	0 %	25 %	50 %	433589360
46	NC_019962	TCT	2	6	2065	2070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433589360
47	NC_019962	ACG	2	6	2086	2091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
48	NC_019962	GTC	3	9	2097	2105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589360
49	NC_019962	TCG	2	6	2131	2136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589360
50	NC_019962	GAC	2	6	2148	2153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
51	NC_019962	TC	3	6	2165	2170	0 %	50 %	0 %	50 %	433589360
52	NC_019962	ATC	2	6	2208	2213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433589360
53	NC_019962	ACG	2	6	2302	2307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
54	NC_019962	G	6	6	2357	2362	0 %	0 %	100 %	0 %	433589360
55	NC_019962	TG	3	6	2389	2394	0 %	50 %	50 %	0 %	433589360
56	NC_019962	CGC	2	6	2402	2407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589360
57	NC_019962	CTG	2	6	2442	2447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589360
58	NC_019962	CCG	2	6	2452	2457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589360
59	NC_019962	TCG	2	6	2491	2496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589360
60	NC_019962	GTC	2	6	2541	2546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589360
61	NC_019962	GTC	2	6	2550	2555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589360
62	NC_019962	ATC	2	6	2595	2600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433589360
63	NC_019962	GAG	2	6	2670	2675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433589360
64	NC_019962	TCA	2	6	2716	2721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433589360
65	NC_019962	CGT	3	9	2753	2761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589360
66	NC_019962	GAG	2	6	2814	2819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433589360
67	NC_019962	TCC	2	6	2830	2835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433589360
68	NC_019962	CGA	2	6	2861	2866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589360
69	NC_019962	CCG	2	6	3025	3030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589361
70	NC_019962	GAC	2	6	3150	3155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589361
71	NC_019962	GCC	2	6	3159	3164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589361
72	NC_019962	CAGT	2	8	3179	3186	25 %	25 %	25 %	25 %	433589361
73	NC_019962	GAC	2	6	3246	3251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589361
74	NC_019962	GTTC	2	8	3252	3259	0 %	50 %	25 %	25 %	433589361
75	NC_019962	GTT	2	6	3294	3299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433589361
76	NC_019962	CGT	2	6	3320	3325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589361
77	NC_019962	AGCG	2	8	3326	3333	25 %	0 %	50 %	25 %	433589361
78	NC_019962	CGA	2	6	3368	3373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589361
79	NC_019962	CTC	2	6	3375	3380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433589361
80	NC_019962	TTC	2	6	3409	3414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433589361
81	NC_019962	GATG	2	8	3434	3441	25 %	25 %	50 %	0 %	433589361
82	NC_019962	CGT	2	6	3447	3452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589361
83	NC_019962	TCGG	2	8	3467	3474	0 %	25 %	50 %	25 %	433589361
84	NC_019962	TTC	2	6	3519	3524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433589361
85	NC_019962	CGA	2	6	3590	3595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589361
86	NC_019962	GCG	2	6	3656	3661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589361
87	NC_019962	AAC	2	6	3682	3687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433589361
88	NC_019962	AGG	2	6	3688	3693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433589361
89	NC_019962	CGA	2	6	3695	3700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589361
90	NC_019962	CGA	2	6	3704	3709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589361
91	NC_019962	GCT	2	6	3717	3722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589361
92	NC_019962	TCG	3	9	3751	3759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589361
93	NC_019962	GAC	2	6	3777	3782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589361
94	NC_019962	CGT	2	6	3785	3790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589361
95	NC_019962	CGT	2	6	3806	3811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589361
96	NC_019962	GCT	2	6	3836	3841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589361
97	NC_019962	CGC	2	6	3885	3890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589361
98	NC_019962	TCGCCG	2	12	3904	3915	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433589361
99	NC_019962	G	6	6	3924	3929	0 %	0 %	100 %	0 %	433589361
100	NC_019962	GCC	2	6	3973	3978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_019962	TCG	2	6	3993	3998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019962	CGC	2	6	4010	4015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_019962	CGA	2	6	4102	4107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589362
104	NC_019962	CGCC	2	8	4114	4121	0 %	0 %	25 %	75 %	433589362
105	NC_019962	CAG	2	6	4133	4138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589362
106	NC_019962	GAC	2	6	4223	4228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589362
107	NC_019962	TGA	2	6	4288	4293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433589362
108	NC_019962	CGT	2	6	4297	4302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589362
109	NC_019962	AGCG	2	8	4303	4310	25 %	0 %	50 %	25 %	433589362
110	NC_019962	TCG	2	6	4417	4422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589362
111	NC_019962	ACG	3	9	4455	4463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589362
112	NC_019962	CG	3	6	4510	4515	0 %	0 %	50 %	50 %	433589362
113	NC_019962	TCG	2	6	4563	4568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589362
114	NC_019962	TGC	2	6	4609	4614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589362
115	NC_019962	CCA	2	6	4627	4632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433589362
116	NC_019962	GCG	2	6	4633	4638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589362
117	NC_019962	CAG	2	6	4661	4666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589362
118	NC_019962	CGA	2	6	4672	4677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589362
119	NC_019962	CGA	2	6	4681	4686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589362
120	NC_019962	CGC	2	6	4697	4702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589362
121	NC_019962	CCG	2	6	4720	4725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589362
122	NC_019962	GTC	2	6	4730	4735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589362
123	NC_019962	CGT	2	6	4762	4767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589362
124	NC_019962	CGGG	2	8	4787	4794	0 %	0 %	75 %	25 %	433589362
125	NC_019962	GTCG	2	8	4807	4814	0 %	25 %	50 %	25 %	433589362
126	NC_019962	GCC	2	6	4833	4838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589362
127	NC_019962	CGG	2	6	4852	4857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589362
128	NC_019962	CGG	2	6	4859	4864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589362
129	NC_019962	TCG	2	6	4866	4871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589362
130	NC_019962	CGG	2	6	4958	4963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019962	GTCG	2	8	4970	4977	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_019962	TCCCG	2	10	5005	5014	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
133	NC_019962	AGC	2	6	5022	5027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019962	CGGT	2	8	5029	5036	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_019962	CG	3	6	5117	5122	0 %	0 %	50 %	50 %	433589363
136	NC_019962	TCG	2	6	5125	5130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589363
137	NC_019962	GTC	2	6	5250	5255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589363
138	NC_019962	GGC	2	6	5273	5278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589363
139	NC_019962	CGG	2	6	5284	5289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589363
140	NC_019962	CGC	2	6	5297	5302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589363
141	NC_019962	CCG	2	6	5314	5319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589363
142	NC_019962	GCC	2	6	5325	5330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589363
143	NC_019962	AACC	2	8	5369	5376	50 %	0 %	0 %	50 %	433589363
144	NC_019962	CGA	2	6	5387	5392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589363
145	NC_019962	CCGG	2	8	5394	5401	0 %	0 %	50 %	50 %	433589363
146	NC_019962	G	7	7	5420	5426	0 %	0 %	100 %	0 %	433589363
147	NC_019962	CGCC	2	8	5431	5438	0 %	0 %	25 %	75 %	433589363
148	NC_019962	TCG	2	6	5476	5481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589363
149	NC_019962	CGAC	2	8	5543	5550	25 %	0 %	25 %	50 %	433589363
150	NC_019962	GGC	2	6	5562	5567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589363
151	NC_019962	ACC	2	6	5587	5592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433589363
152	NC_019962	GGC	2	6	5622	5627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589363
153	NC_019962	CTGG	2	8	5723	5730	0 %	25 %	50 %	25 %	433589363
154	NC_019962	TGA	2	6	5731	5736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433589363
155	NC_019962	CGA	2	6	5762	5767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589363
156	NC_019962	GAC	2	6	5811	5816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589363
157	NC_019962	TCG	2	6	5830	5835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589363
158	NC_019962	GGC	2	6	5900	5905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589363
159	NC_019962	CTG	3	9	6009	6017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589363
160	NC_019962	GGCGTC	2	12	6036	6047	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433589363
161	NC_019962	TCG	2	6	6076	6081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589363
162	NC_019962	AAG	2	6	6120	6125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433589363
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165	NC_019962	ACG	2	6	6355	6360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589363
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168	NC_019962	CGC	2	6	6406	6411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589363
169	NC_019962	AGG	2	6	6445	6450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433589363
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174	NC_019962	TCG	2	6	6619	6624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589363
175	NC_019962	TGCG	2	8	6681	6688	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
176	NC_019962	CCT	2	6	6729	6734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
177	NC_019962	GCTT	2	8	6767	6774	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
178	NC_019962	GTC	2	6	6810	6815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_019962	TCAC	2	8	6832	6839	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
180	NC_019962	TCT	2	6	6862	6867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_019962	CGG	3	9	6979	6987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589364
182	NC_019962	GATCG	2	10	6992	7001	20 %	20 %	40 %	20 %	433589364
183	NC_019962	GGC	2	6	7010	7015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589364
184	NC_019962	ACCGG	2	10	7051	7060	20 %	0 %	40 %	40 %	433589364
185	NC_019962	CAG	2	6	7067	7072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589364
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187	NC_019962	CG	4	8	7126	7133	0 %	0 %	50 %	50 %	433589364
188	NC_019962	TCC	2	6	7158	7163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433589364
189	NC_019962	CGT	2	6	7174	7179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589364
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191	NC_019962	GCGTCG	2	12	7299	7310	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433589364
192	NC_019962	CAC	2	6	7507	7512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
193	NC_019962	CGT	2	6	7548	7553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589365
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196	NC_019962	CCGCG	2	10	7599	7608	0 %	0 %	40 %	60 %	433589365
197	NC_019962	CGC	3	9	7617	7625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589365
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230	NC_019962	TCGA	2	8	8759	8766	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
231	NC_019962	CGT	2	6	8781	8786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
232	NC_019962	AAC	2	6	8827	8832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
233	NC_019962	CGG	2	6	8966	8971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433589366
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244	NC_019962	GTC	3	9	9184	9192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589366
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247	NC_019962	CGAG	2	8	9257	9264	25 %	0 %	50 %	25 %	433589366
248	NC_019962	CGC	2	6	9297	9302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589366
249	NC_019962	GCGG	2	8	9329	9336	0 %	0 %	75 %	25 %	433589366
250	NC_019962	GGCGA	2	10	9337	9346	20 %	0 %	60 %	20 %	433589366
251	NC_019962	TCG	2	6	9425	9430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589366
252	NC_019962	CCGACG	2	12	9439	9450	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433589366
253	NC_019962	ACG	2	6	9461	9466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589366
254	NC_019962	CGA	2	6	9500	9505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_019962	GCC	2	6	9534	9539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
256	NC_019962	TGA	2	6	9552	9557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
257	NC_019962	ATCC	2	8	9562	9569	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
258	NC_019962	ACGG	2	8	9574	9581	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
259	NC_019962	CG	3	6	9624	9629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
260	NC_019962	GTC	2	6	9667	9672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589367
261	NC_019962	TCG	2	6	9764	9769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589367
262	NC_019962	CCT	2	6	9771	9776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433589367
263	NC_019962	CGA	2	6	9834	9839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589367
264	NC_019962	CCG	2	6	9878	9883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589367
265	NC_019962	CGT	2	6	9909	9914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433589367
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267	NC_019962	GAG	2	6	9967	9972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433589367
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269	NC_019962	ACG	2	6	10006	10011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433589367
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289	NC_019962	CCG	2	6	10877	10882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433589367
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